Forrest Maureen

[Victoria Nelly]

Schneider et Excoffier, 1999) avec Arlequin. De plus, nous avons puma suede utilisé le programme Beast 1.6.1 (Drummond et Rambaut, 2007) pour estimer les temps de coalescence et la démographie passée. Nous avons défini le meilleur modèle de substitution de nucléotides pour notre ensemble de données, à savoir le modèle G de HKY (Hasegawa et al., 1985), à l'aide du critère d'information Akaike (AIC, Akaike, 1974) mis en S
uvre dans jModelTest 0.1 (Posada, 2008).

Nous avons supposé que les pumas et les jaguarundis divergeaient entre 3,16 et 6,01 MYA (95% HPD de l'estimation rapportée par Johnson et al. (2006) en utilisant une supermatrix nucléaire). Nous avons appliqué un uniforme avant en utilisant ces âges comme limites minimales et puma creepers maximales conservatrices, respectivement. La dernière analyse était basée sur 10 8 générations MCMC, avec des échantillons prélevés toutes les 10 4 étapes et les 10 premières étapes supprimées lors de l inactivation.

Est de l'Amérique du Sud (ESA, en vert puma heart clair), centre-sud de l'Amérique du Sud (CSSA, en bleu clair) et sud-ouest de l'Amérique du Sud ( SWSA, en violet).L'ensemble de données puma contenait 33 sites variables (32 transitions et une transversion), dont 25 étaient informatifs sur le plan phylogénétique (tableau 1). Au total, il y avait 28 haplotypes, dont 22 en Amérique du Sud (H01  H22), l'un d'eux (H09) étant partagé avec l'Amérique centrale (Figure 2A).

Pour étudier la structure génétique de la population puma rihanna de manière plus quantitative, nous avons effectué plusieurs séries d AMOVA, en utilisant différentes stratégies de regroupement géographique. Au premier stade, lorsque seules les pumas d'Amérique du Sud ont été analysées, les valeurs de st étaient relativement élevées et statistiquement significatives, la stratégie 1c donnant le st global le plus élevé (tableau 3). Lors du deuxième cycle d AMOVA, en utilisant l ensemble de l échantillon.

L Amérique centrale était mieux représentée en deux groupes distincts, nord et sud, le premier étant fusionné avec l Amérique du Nord. Dans le meilleur scénario à deux niveaux (voir tableau 3), nous avons également noté que les valeurs sc et ct étaient respectivement égales à 0,41904.Des estimations par paires de st ont été réalisées aux différentes échelles spatiales testées dans ces scénarios et ont permis d'évaluer puma trinomic le caractère distinctif des unités de population à grande échelle et régionales.

Pour les pumas d'Amérique du Sud, le tMRC moyen a été estimé à 0,211 (0,091 0,353) MYA. Lorsque les échantillons d'Amérique du Nord (Amérique du Nord) et d'Amérique centrale (AC) ont été analysés séparément, leur estimation moyenne de t MRCA était de 0,231 MYA . Enfin, nous avons estimé le t MRCA pour un sous-ensemble de 24 échantillons d AC NA formant un groupe monophylétique endémique , ce qui donne une valeur de .L'analyse bayésienne du tracé de l'horizon [img]http://www.setteottavi.com/images/chaussure/puma trinomic-326hiu.jpg[/img] a révélé la preuve d'une expansion démographique très récente.

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